Učenci so organizirani v oddelčne skupnosti, ki jih vodi izvoljeni odbor. Vse oddelčne skupnosti so povezane v šolsko skupnost, ki sprejme program dela za tekoče šolsko leto. Pri oblikovanju programa sodelujejo vsi učenci. Predstavniki oddelčnih skupnosti se sestanejo nekajkrat letno. Šolsko skupnost vodijo: predsednik, namestnik, tajnik in mentorici. O sklepih sestankov pišejo zapisnik in ga posredujejo vsem oddelčnim skupnostim. Na šoli je tudi parlament. Sestavljajo ga po 2 predstavnika vsake oddelčne skupnosti (RS, PS) – to so delegati oddelčne skupnosti. Šolski parlament se sestane dvakrat letno: septembra in junija. Skliče ga mentor šolske skupnosti ali ravnateljica šole. Na podružničnih šola je sistem organiziranosti enak.
Mentorici sta Urška Cerar in Polonca Maček.
